近畿税理士会でも電子証明書（第四世代）の配布を受けましたので，eTaxソフト，eLTaxソフトへの証明書更新作業をしてみました。
eTaxソフト
（１）利用者情報登録をクリック
（２）電子証明書登録・更新をクリック
以上のながれで登録ができました。
eLTaxソフト
（１）利用者情報メニューをクリック
（２）電子証明書差替えをクリック
→画面の表示通り進んでいくのですが，自分が提出している市町村（私の場合，大阪市）へ新しい電子証明書で署名を行い，送信をすればOKです。
→詳細なマニュアルによれば，各市区町村へ証明書の差替えを連絡する必要はなく，一か所に連絡をすれば，すべて通知がいくようです。
両ソフトでいえることは，古い電子証明書を使わず，最初から電子証明書（第四世代）をICカードリーダーに入れたまま作業を行う必要があるということです。
よく読まずにしていると，最初に古い電子証明書で認証を行い，新しい電子証明書を登録するのかと悩みました。
無事に登録ができて一安心です。